Flora.
Desde el punto de vista florístico probablemente Fuencaliente sea el municipio de la isla que presenta un menor número de especies, debido principalmente a su juventud geológica, con lo que se hace fundamental la presencia de especies pioneras o primocolonizadoras.
La especie más abundante es el pino canario (Pinus canariensis) que ocupa gran parte del territorio del municipio, al menos por encima de los 700 metros de altura.
Por debajo de los 600 m. son fundamentalmente dominantes los matorrales de higuerilla (E. obtusifolia) y la retama (R. rhodorhizoides) que junto con los pinos caracterizan gran parte del paisaje insular.
Es importante citar a los líquenes como primocolonizadores, ya que comienzan la sucesión en la colonización de los malpaíses, abriendo paso a las comunidades de helechos xerofíticos y más tarde al asentamiento de bejeques y cardoncillos, sobre todo hacia oriente, mientras que hacia occidente aparece el bejeque rojo (Aeonium nobile). En las zonas más térmicas y edafoxerófilas es la tabaiba dulce la que adquiere un mayor protagonismo.
Como principal especie agrícola, es la vid la que se ha erigido como el cultivo principal del municipio, quedando en un segundo plano el cultivo de plátanos que ocupa la isla baja situada al oeste.
Fauna.
Con respecto a a la fauna en Fuencaliente se puede destacar los siguientes grupos:

Reptiles: es un grupo diverso con poblaciones abundantes, sobre todo en la costa, destacando los lagartos, sobre las salamanquesas.
Aves: poblaciones poco abundantes ampliamente distribuidas por todo el Municipio (siempre dentro de sus hábitats). Como relevante, se puede citar el avistamiento de dos individuos de águila pescadora entre la Punta del Banco y El Remo.
Mamíferos: Representados principalmente por 9 especies, en su mayoría introducidas por el hombre y que en muchos casos forman poblaciones asilvestradas. Respecto a especies autóctonas sólo pueden considerarse a los murciélagos.
Invertebrados: Se han catalogado 242 especies, de las cuales 205 (85 %) son endemismos canarios y dentro de estos, 66 (27 %) son endemismos insulares. Según el Borrador del “Catálogo Preliminar de Fauna Invertebrada Amenazada de Canarias”, 10 de las 242 especies están propuestas para ser amparadas por algún grado de protección.
El número de endemismos locales es escaso estando en algunos casos seriamente amenazados debido a lo limitado de su hábitat y a las enormes presiones inmobiliarias que existen en la zona. En el Término Municipal de Fuencaliente existen 7 especies singulares, e importantes desde el punto de vista de la conservación por su condición de endemismos locales.
El 49 % de la fauna invertebrada está vinculada a el tajinaste o arrebol (Echium brevirame), la tabaiba (Euphorbia balsamifera) la higuerilla (E. obtusifolia), el pino canario (Pinus canariensis), y el codeso (Adenocarpus foliolosus).
